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PI染色：碘化丙啶(PI)是一種不滲透膜的紅色熒光染料，可染色DNA。PI通常被排除在活細胞之外，并且可以穿透受損的細胞，因此通常用于鑒定細胞的活力。 PI適用于熒光顯微鏡和流式細胞儀。碘化丙啶(PI)屬于溴化乙啶相似化合物。
鬼筆環肽染色：鬼筆環肽是一種雙環七肽，最早發現的環狀肽之一，是從鬼筆鵝膏（Amanita phalloides）中分離出來的。通過結合和穩定纖維狀肌動蛋白（F-actin）發揮功能，并有效防止肌動蛋白纖維解聚。由于其與F-肌動蛋白的緊密和選擇性結合，從而顯示微絲骨架在細胞中的分布，因此含鬼筆環肽的熒光標記已廣泛用于生物顯微技術中。
DAPI單染色的基本原理和應用 DAPI（4',6-二脒基-2苯基吲哚）是一種常用的熒光染料，它可以與雙鏈DNA的AT區結合，結合后熒光增強約20倍。DAPI的最大激發波長為340nm，最大發射波長 為488nm。由于其能夠透過完整的細胞膜，DAPI不僅可以用于固定細胞的染色，也可以用于活細胞的染色。在熒光顯微鏡下，DAPI染色通常用于觀察細胞核和檢測細胞凋亡。
WGA染色的基本原理和應用 麥胚凝集素（WGA）是一種與N-乙酰-D-葡萄糖胺和唾液酸結合的凝集素。它是目前研究多、應用廣泛的一類凝集素。由于WGA與糖綴合物結合，其衍生物和綴合物被廣泛用于標記細胞膜和纖維化瘢痕組織，用于熒光成像和分析。
Fluoro-Jade C染色是一種用于檢測神經元退化和凋亡的技術。這種染色方法特別適用于觀察腦損傷、神經退行性疾病（如阿爾茨海默病、帕金森病等）、中風、癲癇等情況下的神經元變化。
Edu染色是一種用于標記和檢測細胞增殖的方法，通過特定的化學反應來識別處于S期的細胞
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